当地时间7月10日凌晨，韩国首尔中央地方法院批准了内乱特检组对尹锡悦提出的逮捕申请，并签发了逮捕令。尹锡悦随即被当场收押。这是自今年3月8日法院决定取消拘留、予以释放以来，时隔124天再次被拘留。
7月9日下午至晚上，首尔中央地方法院对尹锡悦进行了近7个小时的拘留必要性审查。审查结束后，尹锡悦被送往位于京畿道义王市的首尔拘留所，等待法院判决结果。法院认为尹锡悦有“毁灭证据的可能性”和“逃跑可能性”，因此签发了逮捕令。
内乱特检组方面介绍，尹锡悦在审查过程中做了约20分钟的总结发言，主张指控不成立。特检组当天准备了178张演示文稿，证明尹锡悦因破坏法治主义和司法秩序而应被拘捕。特检组还向法院提交了长达约300页的意见书。尹锡悦的律师团也展示了167张演示文稿，对特检组的指控进行反驳。
首尔中央地方法院接受了特检组的主张，认为尹锡悦谎称经过合法程序宣布紧急戒严，却在紧急戒严被解除后才制作虚假文件，并指示删除共犯的加密电话记录等行为相当于毁灭证据。此外，尹锡悦多次拒绝调查机关传唤，在内乱审判中采取不合作态度，法院认为他有逃跑的可能性。
接下来，尹锡悦将在拘押状态下继续接受调查及“内乱案”的庭审。本月6日，特检组以涉嫌滥用职权等为由提请法院批捕尹锡悦。被捕后，特检组将对其进行最长20天的调查。特检组先前表示，尹锡悦涉嫌妨碍执行特殊公务、违反《总统警卫法》、滥用职权、伪造公文等。之后的调查将集中于尹锡悦的外患罪嫌疑，包括制造戒严理由和派无人机侵入朝鲜首都平壤。
尹锡悦的未来充满不确定性。他涉嫌“发动内乱”的刑事审判正在进行，一旦罪名成立，刑罚只有无期徒刑或死刑。由于韩国已事实性废除死刑，被判死刑等同于终身监禁。再加上一系列新指控，尹锡悦可能将在监狱里度过漫长岁月。韩国总统李在明曾表示，如果尹锡悦被判处终身监禁，不应得到赦免。前总统卢武铉的女婿郭相彦提议修改《赦免法》，不允许总统赦免因内乱罪和外患罪被定罪的人。
